席卷MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、限度花瓣外皮细胞形态的M

  金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),车前科众年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常睹的盆栽、切花及天井赏玩的园艺花草,正在古罗马期间就已实现了驯化。正在过去的三十年中,金鱼草不绝行为分子和发育遗传学的形式作物,良众症结基因是正在金鱼草中被初次挖掘,囊括MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、独揽花瓣外皮细胞式样的MYB基因MIXTA、花色基因ROSEA、VENOSA以及独揽自交不亲和的SLFs(S-Loucs F-box)等。金鱼草中内正在灵活的转座子增进了基因的分别和判辨。可是,迄今为止,这些探讨都是正在贫乏基因组序列前提下举办的,无法探讨这些基因、转座子和性状的整个进化和遗传构造。

  今天,中邦科学院遗传与发育生物学探讨所薛勇彪探讨组拉拢梁承志探讨组、John Innes中央Enrico Coen探讨组和华大基因等探讨团队,运用第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序技巧,纠合遗传图谱辅助拼装计谋,实现了对栽培金鱼草(Antirrhinum majus cv. JI7)的全基因组序列测定。

  该探讨取得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,笼盖度为97.12%,诠释了37714个卵白编码基因,陈说了一个近乎完美的金鱼草基因组。通过对序列的较量判辨显示,车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其比来的祖宗处分隔并正在大约四千六百万到四千九百万年前发作了全基因组复制事情,该全基因组复制对金鱼草中与花过错称性闭系的TCP基因家族进化具有首要功劳。另外,该探讨挖掘金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在大约2Mb的序列上含有102个基因,此中包蕴37个SLF基因但缺失S-RNase,提示该花柱因子的遗失是栽培金鱼草获取自交亲和性状的苛重道理,并挖掘栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性。综上,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化探讨。

  该探讨结果于1月29日正在线宣布正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)。薛勇彪探讨组李苗苗、张冬芬、张辉,梁承志探讨组高强、马斌,中科院北京基因组探讨所骆迎峰和华大基因陈春海为论文的合伙第一作家,薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的合伙通信作家。该探讨取得中科院政策先导项目、邦度科技部及邦度自然科学基金委的经费支柱。

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